晚熟水稻主要防治那些病虫害呢？主要有三个方面：稻飞虱、稻纵卷叶螟、二化螟，这三种害虫是晚熟稻的重点打击对象。
稻飞虱：在全国很多地方都有这样的危害，他们基本都是在7月以后，开始进入大量繁殖阶段，这段时间是扑灭稻飞虱的关键时候，稻飞虱的食物比较单一，基本上只吃水稻和野生稻，而且灰飞虱和白背飞虱除了危害水稻外，还危害其它本科植物，他们主要以群集形式集中在水稻植株下部取食危害，吸食汁液，受害的稻叶就会发黄，叶片背部就会出现褐色的虫卵，繁殖下一代，这个时候就要喷水农药，进行扑杀这些虫卵。
稻纵卷叶螟二代稻纵卷叶螟是水稻一生中发生数量最高、危害最重的一代，须重点防治。稻纵卷叶螟的防治应以农业防治为基础，合理使用农药，协调化学防治与保护利用自然天敌的矛盾，将幼虫的危害控制在经济允许水平之下。
二化螟第一代发生严重与否，与越冬虫源多少关系密切。如免耕田、小麦田多的地区，越冬虫源就多，第一代发生危害就严重；第二代发生严重程度，与当地插花种植程度关系密切。越冬幼虫抗寒力强，在越冬期间如遇环境不适宜，亦可爬行转移，还可危害小麦和其他杂草。
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